La historia se centra en dos hermanos, Edward Elric y Alphonse Elric que rompieron el mayor tabú de la alquimia, la trasmutación humana al tratar de revivir a su fallecida madre; en consecuencia Edward pierde su pierna izquierda y Alphonse pierde todo su cuerpo, Edward para salvar a su hermano sella su alma en una gran armadura de hierro a cambio de su brazo derecho; ahora los dos con un nuevo objetivo buscan desesperadamente la piedra filosofal para poder regresar sus cuerpos a la normalidad...
CAPITULOS
1 - El Alquimista de Acero
2 - El día del inicio
3 - La ciudad de la herejía
4 - Angustia del Alquimista
5 - Lluvia de tristeza
6 - El camino de la Esperanza
7 - La Verdad Oculta
8 - Investigando el Laboratorio V
9 - Sentimientos Artificiales
10 - Caminos Separados
11 - El milagro de Rush Valley
12 - Uno es todo, todo es uno
13 - Las Bestias de Dublith
14 - Aquellos que se esconden bajo tierra
15 - Emisario del Este
16 - Los pasos de un Camarada de Guerra
17 - Las llamas Serenas
18 - En la Palma de un Arrogante Ser Humano
19 - La Muerte del Inmortal
20 - El Padre frente a la Sepultura
21 - El Progreso de los Tontos
22 - Espaldas Distantes
23 - La chica en el Campo de Batalla
24 - Dentro del Estómago
25 - La Puerta de la Oscuridad
26 - Reunión
27 - Banquete en la Grieta
28 - Father
29 - La Lucha de los Tontos
30 - La Campaña de Aniquilación de Ishbal
31 - La Promesa Hecha por 520 Cenz
32 - El Hijo del Fuhrer
33 - La Muralla del Norte de Briggs
34 - La Reina del Hielo
35 - La Forma de Este País
36 - Retrato de familia
37 - El homúnculo original
38 - Conflicto en Baschool
39 - Soñar despierto
40 - Homúnculo
41 - Infierno
42 - Señales de un contrataque
43 - La mordedura de una hormiga
44 - Una recuperación completa
45 - El día prometido
46 - La sombra cautelosa
47 - Mensajero de la oscuridad
48 - Un juramento hecho bajo tierra
49 - El amor de un padre y un hijo
50 - Agitación en Central
51 - Ejército inmortal
52 - El poder de todos
53 - Las llamas de la venganza
54 - Detrás de las llamas
55 - La manera de vivir de los adultos
56 - El regreso del Führer
57 - Descanso Eterno
58 - Sacrificios humanos
59 - Luz perdida
60 - El ojo del cielo, La puerta de la Tierra
61 - El que se tragó a Dios
62 - El Violento Contraataque